Goplania Inowrocław została założona 16 maja 1921 roku i jest najstarszym oraz najbardziej utytułowanym klubem piłkarskim w Inowrocławiu. Mało znane są fakty z historii drużyny z okresu międzywojennego, jednak wiadomo, że po II Wojnie Światowej klub został reaktywowany i przez 25 lat występował w klasie C.
Dopiero prezes Edmund Grobelski postanowił postawić na futbol w wielosekcyjnym klubie. Dzięki temu Goplania stopniowo pięła się w górę, a pod koniec lat 60. walczyła już o awans do III ligi.
W 1975 roku pojawiła się szansa na grę w II lidze, jednak Goplania przegrała barażowy mecz z Dębem Dębno 0:1. Kolejna okazja nadeszła w 1978 roku — wtedy na stadionie przy ul. Orłowskiej po dramatycznym spotkaniu z MRKS Gdańsk inowrocławianie wygrali 2:1, a zwycięskiego gola zdobył na dwie minuty przed końcem Zbigniew Orczyk.
„W lipcu 1978 roku Goplania zadebiutowała w II lidze, remisując z Zagłębiem Wałbrzych 1:1 przy dopingu 7 tysięcy kibiców na stadionie przy ul. Orłowskiej."
— Kronika klubu Goplania InowrocławNiestety, sezon 1978/79 zakończył się spadkiem (16. miejsce). Przez kolejne dwie dekady klub utrzymywał się w III lidze, notując regularnie lokaty w czołowej czwórce tabeli.
Lata 90. i początek XXI wieku to okres stopniowego upadku. Biało-niebiescy sukcesywnie spadali do coraz niższych klas rozgrywkowych. Od sezonu 2015/16 Goplania grała w klasie A, a w sezonie 2017/18 udało się awansować do klasy okręgowej.
Przed sezonem 2024/2025 stanowisko prezesa objął Dawid Jasiński, a trenerem został Dawid Żurawski. Zespół zakończył jednak rozgrywki B-klasy na 3. miejscu i nie wywalczył awansu do A-klasy. Przed kolejnym sezonem 2025/2026 klub zaskoczył kibiców, ogłaszając podpisanie kontraktu trenerskiego z Damianem Malczewskim. Wzmocniona kadra Goplanii ponownie przystąpiła do rywalizacji w B-klasie z nadzieją na odbudowę dawnej potęgi.